Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBBP6Q7Z6E9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RBBP6Q7Z6E9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RBBP6Q7Z6E9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RBBP6Q7Z6E9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBBP6Q7Z6E9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RBBP6Q7Z6E9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RBBP6Q7Z6E9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms