Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX9Q7RTT3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX9Q7RTT3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX9Q7RTT3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms