Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
OTOP1Q7RTM1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
OTOP1Q7RTM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP1Q7RTM1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
OTOP1Q7RTM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
OTOP1Q7RTM1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP1Q7RTM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms