Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR3Q6ZTQ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDHR3Q6ZTQ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR3Q6ZTQ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR3Q6ZTQ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR3Q6ZTQ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.1 ms