Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX71

PLXDC2, Plexin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC2Q6UX71 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXDC2Q6UX71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXDC2Q6UX71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXDC2Q6UX71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXDC2Q6UX71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXDC2Q6UX71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXDC2Q6UX71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms