Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCIMPQ6UWF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCIMPQ6UWF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCIMPQ6UWF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCIMPQ6UWF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms