Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPSL2Q6UWE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPSL2Q6UWE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPSL2Q6UWE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPSL2Q6UWE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPSL2Q6UWE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPSL2Q6UWE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms