Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD1Q6SPF0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SAMD1Q6SPF0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAMD1Q6SPF0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SAMD1Q6SPF0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms