Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TMED8Q6PL24 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMED8Q6PL24 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TMED8Q6PL24 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMED8Q6PL24 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMED8Q6PL24 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms