Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC27Q6P3X3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TTC27Q6P3X3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC27Q6P3X3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC27Q6P3X3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC27Q6P3X3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms