Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REEP3Q6NUK4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
REEP3Q6NUK4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms