Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPRIN2Q6IMN6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPRIN2Q6IMN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPRIN2Q6IMN6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPRIN2Q6IMN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms