Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPNQ5VXI9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPNQ5VXI9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPNQ5VXI9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms