Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP9Q5VTM2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP9Q5VTM2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP9Q5VTM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGAP9Q5VTM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms