Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms