Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR38Q5JTN6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR38Q5JTN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR38Q5JTN6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms