Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PITRM1Q5JRX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PITRM1Q5JRX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PITRM1Q5JRX3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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