Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTDC1Q4AE62 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTDC1Q4AE62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTDC1Q4AE62 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTDC1Q4AE62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms