Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT71Q3SY84 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT71Q3SY84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT71Q3SY84 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms