Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM71Q2Q1W2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM71Q2Q1W2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM71Q2Q1W2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms