Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB3Q15768 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNB3Q15768 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNB3Q15768 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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