Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NKX1-1Q15270 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NKX1-1Q15270 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NKX1-1Q15270 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NKX1-1Q15270 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NKX1-1Q15270 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NKX1-1Q15270 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NKX1-1Q15270 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NKX1-1Q15270 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NKX1-1Q15270 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NKX1-1Q15270 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NKX1-1Q15270 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NKX1-1Q15270 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NKX1-1Q15270 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms