Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDK1Q15118 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDK1Q15118 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDK1Q15118 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDK1Q15118 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDK1Q15118 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK1Q15118 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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