Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF9Q07011 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF9Q07011 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF9Q07011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms