Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF8Q02556 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF8Q02556 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF8Q02556 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF8Q02556 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF8Q02556 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms