Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX1P78414 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX1P78414 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX1P78414 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX1P78414 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX1P78414 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX1P78414 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX1P78414 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX1P78414 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX1P78414 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX1P78414 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX1P78414 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX1P78414 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX1P78414 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX1P78414 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX1P78414 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX1P78414 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX1P78414 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX1P78414 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX1P78414 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX1P78414 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX1P78414 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX1P78414 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX1P78414 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX1P78414 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX1P78414 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX1P78414 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX1P78414 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX1P78414 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX1P78414 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX1P78414 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX1P78414 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX1P78414 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX1P78414 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX1P78414 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX1P78414 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX1P78414 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX1P78414 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX1P78414 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX1P78414 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX1P78414 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX1P78414 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX1P78414 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX1P78414 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX1P78414 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX1P78414 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX1P78414 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX1P78414 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX1P78414 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX1P78414 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX1P78414 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX1P78414 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX1P78414 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX1P78414 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX1P78414 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX1P78414 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX1P78414 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX1P78414 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX1P78414 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX1P78414 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX1P78414 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX1P78414 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX1P78414 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX1P78414 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX1P78414 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX1P78414 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX1P78414 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX1P78414 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX1P78414 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX1P78414 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX1P78414 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX1P78414 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX1P78414 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX1P78414 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX1P78414 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX1P78414 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX1P78414 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX1P78414 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX1P78414 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX1P78414 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX1P78414 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX1P78414 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX1P78414 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX1P78414 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX1P78414 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX1P78414 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX1P78414 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX1P78414 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX1P78414 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX1P78414 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX1P78414 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX1P78414 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX1P78414 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX1P78414 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX1P78414 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX1P78414 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX1P78414 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX1P78414 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX1P78414 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX1P78414 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms