Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX17P56962 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX17P56962 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX17P56962 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX17P56962 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX17P56962 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX17P56962 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX17P56962 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX17P56962 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX17P56962 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX17P56962 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX17P56962 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX17P56962 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX17P56962 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX17P56962 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX17P56962 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STX17P56962 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STX17P56962 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX17P56962 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX17P56962 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX17P56962 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX17P56962 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX17P56962 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX17P56962 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX17P56962 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX17P56962 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
STX17P56962 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX17P56962 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX17P56962 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX17P56962 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX17P56962 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX17P56962 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX17P56962 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX17P56962 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX17P56962 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STX17P56962 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX17P56962 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX17P56962 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX17P56962 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX17P56962 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX17P56962 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX17P56962 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX17P56962 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX17P56962 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX17P56962 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX17P56962 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX17P56962 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX17P56962 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STX17P56962 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX17P56962 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX17P56962 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX17P56962 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX17P56962 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX17P56962 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX17P56962 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX17P56962 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX17P56962 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX17P56962 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STX17P56962 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STX17P56962 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX17P56962 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX17P56962 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
STX17P56962 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX17P56962 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STX17P56962 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STX17P56962 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX17P56962 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX17P56962 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX17P56962 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX17P56962 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX17P56962 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX17P56962 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX17P56962 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX17P56962 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
STX17P56962 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX17P56962 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX17P56962 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX17P56962 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX17P56962 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX17P56962 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX17P56962 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX17P56962 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX17P56962 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX17P56962 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX17P56962 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX17P56962 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX17P56962 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
STX17P56962 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX17P56962 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX17P56962 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX17P56962 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX17P56962 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX17P56962 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX17P56962 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX17P56962 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX17P56962 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX17P56962 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STX17P56962 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX17P56962 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX17P56962 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms