Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELLP55199 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELLP55199 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELLP55199 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELLP55199 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELLP55199 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELLP55199 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELLP55199 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ELLP55199 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELLP55199 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELLP55199 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELLP55199 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELLP55199 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELLP55199 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELLP55199 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELLP55199 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELLP55199 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELLP55199 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELLP55199 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELLP55199 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELLP55199 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELLP55199 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELLP55199 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELLP55199 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELLP55199 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELLP55199 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELLP55199 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELLP55199 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELLP55199 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELLP55199 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELLP55199 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELLP55199 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELLP55199 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELLP55199 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ELLP55199 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ELLP55199 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ELLP55199 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ELLP55199 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ELLP55199 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ELLP55199 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ELLP55199 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ELLP55199 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ELLP55199 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ELLP55199 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ELLP55199 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ELLP55199 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ELLP55199 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ELLP55199 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ELLP55199 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ELLP55199 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ELLP55199 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ELLP55199 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ELLP55199 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELLP55199 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELLP55199 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELLP55199 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELLP55199 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELLP55199 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELLP55199 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ELLP55199 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELLP55199 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELLP55199 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELLP55199 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELLP55199 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELLP55199 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELLP55199 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELLP55199 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELLP55199 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELLP55199 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELLP55199 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELLP55199 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELLP55199 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELLP55199 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELLP55199 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELLP55199 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELLP55199 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELLP55199 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELLP55199 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELLP55199 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELLP55199 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELLP55199 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELLP55199 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELLP55199 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELLP55199 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELLP55199 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELLP55199 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELLP55199 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELLP55199 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ELLP55199 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELLP55199 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELLP55199 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELLP55199 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELLP55199 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms