Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCCSP53701 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCCSP53701 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCCSP53701 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCCSP53701 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCCSP53701 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HCCSP53701 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCCSP53701 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCCSP53701 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCCSP53701 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCCSP53701 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCCSP53701 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCCSP53701 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCCSP53701 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCCSP53701 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCCSP53701 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCCSP53701 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCCSP53701 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCCSP53701 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCCSP53701 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HCCSP53701 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCCSP53701 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCCSP53701 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCCSP53701 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCCSP53701 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCCSP53701 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCCSP53701 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCCSP53701 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCCSP53701 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCCSP53701 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCCSP53701 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCCSP53701 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCCSP53701 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCCSP53701 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCCSP53701 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCCSP53701 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCCSP53701 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCCSP53701 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCCSP53701 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCCSP53701 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCCSP53701 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCCSP53701 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCCSP53701 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCCSP53701 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCCSP53701 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCCSP53701 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCCSP53701 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCCSP53701 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCCSP53701 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCCSP53701 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCCSP53701 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCCSP53701 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCCSP53701 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HCCSP53701 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCCSP53701 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCCSP53701 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCCSP53701 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCCSP53701 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCCSP53701 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCCSP53701 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCCSP53701 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCCSP53701 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCCSP53701 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCCSP53701 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCCSP53701 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCCSP53701 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCCSP53701 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCCSP53701 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCCSP53701 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCCSP53701 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCCSP53701 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCCSP53701 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCCSP53701 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HCCSP53701 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCCSP53701 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCCSP53701 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCCSP53701 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCCSP53701 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCCSP53701 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HCCSP53701 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCCSP53701 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCCSP53701 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCCSP53701 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCCSP53701 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCCSP53701 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCCSP53701 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCCSP53701 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCCSP53701 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCCSP53701 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCCSP53701 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCCSP53701 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCCSP53701 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCCSP53701 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms