Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT20P35900 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT20P35900 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT20P35900 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT20P35900 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT20P35900 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT20P35900 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT20P35900 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT20P35900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT20P35900 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT20P35900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT20P35900 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT20P35900 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT20P35900 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT20P35900 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT20P35900 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT20P35900 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT20P35900 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT20P35900 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT20P35900 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT20P35900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT20P35900 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT20P35900 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT20P35900 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT20P35900 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT20P35900 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT20P35900 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT20P35900 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT20P35900 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT20P35900 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT20P35900 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT20P35900 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT20P35900 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT20P35900 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT20P35900 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT20P35900 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT20P35900 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT20P35900 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT20P35900 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT20P35900 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT20P35900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT20P35900 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT20P35900 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT20P35900 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT20P35900 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT20P35900 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT20P35900 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT20P35900 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT20P35900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT20P35900 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT20P35900 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT20P35900 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT20P35900 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT20P35900 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT20P35900 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT20P35900 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT20P35900 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT20P35900 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT20P35900 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT20P35900 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT20P35900 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT20P35900 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT20P35900 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT20P35900 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT20P35900 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT20P35900 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT20P35900 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT20P35900 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT20P35900 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT20P35900 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT20P35900 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT20P35900 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT20P35900 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT20P35900 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT20P35900 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT20P35900 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT20P35900 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT20P35900 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT20P35900 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT20P35900 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT20P35900 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT20P35900 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT20P35900 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT20P35900 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT20P35900 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT20P35900 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT20P35900 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT20P35900 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms