Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYLC1P35663 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYLC1P35663 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CYLC1P35663 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms