Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSP1P33241 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSP1P33241 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LSP1P33241 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSP1P33241 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSP1P33241 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSP1P33241 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSP1P33241 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSP1P33241 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSP1P33241 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSP1P33241 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSP1P33241 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSP1P33241 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSP1P33241 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSP1P33241 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSP1P33241 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSP1P33241 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSP1P33241 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSP1P33241 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSP1P33241 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSP1P33241 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSP1P33241 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSP1P33241 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSP1P33241 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSP1P33241 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LSP1P33241 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSP1P33241 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSP1P33241 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSP1P33241 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSP1P33241 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSP1P33241 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSP1P33241 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSP1P33241 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSP1P33241 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSP1P33241 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSP1P33241 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSP1P33241 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSP1P33241 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSP1P33241 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSP1P33241 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSP1P33241 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSP1P33241 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSP1P33241 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSP1P33241 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSP1P33241 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSP1P33241 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSP1P33241 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSP1P33241 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSP1P33241 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LSP1P33241 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LSP1P33241 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSP1P33241 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSP1P33241 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSP1P33241 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSP1P33241 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSP1P33241 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSP1P33241 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSP1P33241 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSP1P33241 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSP1P33241 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSP1P33241 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSP1P33241 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSP1P33241 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSP1P33241 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSP1P33241 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSP1P33241 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSP1P33241 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSP1P33241 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSP1P33241 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSP1P33241 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSP1P33241 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSP1P33241 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSP1P33241 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSP1P33241 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSP1P33241 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSP1P33241 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LSP1P33241 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LSP1P33241 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LSP1P33241 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSP1P33241 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSP1P33241 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSP1P33241 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSP1P33241 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSP1P33241 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSP1P33241 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSP1P33241 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSP1P33241 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSP1P33241 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LSP1P33241 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSP1P33241 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSP1P33241 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSP1P33241 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSP1P33241 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms