Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAMP1P23763 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAMP1P23763 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP1P23763 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms