Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMSP20962 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMSP20962 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMSP20962 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMSP20962 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMSP20962 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTMSP20962 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTMSP20962 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTMSP20962 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTMSP20962 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTMSP20962 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTMSP20962 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTMSP20962 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTMSP20962 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTMSP20962 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTMSP20962 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTMSP20962 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTMSP20962 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTMSP20962 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTMSP20962 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTMSP20962 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTMSP20962 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTMSP20962 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTMSP20962 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTMSP20962 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTMSP20962 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTMSP20962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTMSP20962 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTMSP20962 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTMSP20962 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTMSP20962 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTMSP20962 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTMSP20962 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTMSP20962 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTMSP20962 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTMSP20962 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTMSP20962 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTMSP20962 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTMSP20962 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTMSP20962 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTMSP20962 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTMSP20962 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTMSP20962 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTMSP20962 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTMSP20962 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTMSP20962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTMSP20962 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTMSP20962 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTMSP20962 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTMSP20962 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTMSP20962 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTMSP20962 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTMSP20962 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTMSP20962 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMSP20962 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMSP20962 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMSP20962 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMSP20962 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTMSP20962 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTMSP20962 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTMSP20962 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTMSP20962 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTMSP20962 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTMSP20962 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTMSP20962 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTMSP20962 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTMSP20962 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTMSP20962 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTMSP20962 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTMSP20962 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTMSP20962 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTMSP20962 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTMSP20962 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTMSP20962 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTMSP20962 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTMSP20962 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTMSP20962 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTMSP20962 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTMSP20962 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTMSP20962 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTMSP20962 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTMSP20962 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTMSP20962 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTMSP20962 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTMSP20962 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTMSP20962 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTMSP20962 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTMSP20962 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTMSP20962 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTMSP20962 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTMSP20962 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTMSP20962 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTMSP20962 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTMSP20962 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTMSP20962 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMSP20962 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMSP20962 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMSP20962 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTMSP20962 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTMSP20962 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms