Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN19P0C672 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN19P0C672 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN19P0C672 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN19P0C672 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN19P0C672 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN19P0C672 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms