Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYBBP04839 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYBBP04839 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYBBP04839 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYBBP04839 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYBBP04839 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYBBP04839 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYBBP04839 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYBBP04839 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYBBP04839 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYBBP04839 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYBBP04839 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYBBP04839 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CYBBP04839 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYBBP04839 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYBBP04839 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CYBBP04839 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYBBP04839 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYBBP04839 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYBBP04839 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYBBP04839 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYBBP04839 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CYBBP04839 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYBBP04839 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYBBP04839 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYBBP04839 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYBBP04839 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYBBP04839 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYBBP04839 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYBBP04839 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYBBP04839 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYBBP04839 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYBBP04839 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYBBP04839 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYBBP04839 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYBBP04839 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYBBP04839 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYBBP04839 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYBBP04839 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYBBP04839 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYBBP04839 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYBBP04839 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYBBP04839 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYBBP04839 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYBBP04839 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYBBP04839 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYBBP04839 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYBBP04839 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYBBP04839 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYBBP04839 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYBBP04839 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CYBBP04839 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYBBP04839 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYBBP04839 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYBBP04839 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYBBP04839 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYBBP04839 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYBBP04839 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYBBP04839 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYBBP04839 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYBBP04839 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYBBP04839 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYBBP04839 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYBBP04839 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYBBP04839 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYBBP04839 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYBBP04839 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYBBP04839 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYBBP04839 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYBBP04839 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYBBP04839 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CYBBP04839 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CYBBP04839 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CYBBP04839 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYBBP04839 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYBBP04839 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYBBP04839 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYBBP04839 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYBBP04839 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYBBP04839 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYBBP04839 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYBBP04839 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYBBP04839 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYBBP04839 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms