Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1QAP02745 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1QAP02745 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1QAP02745 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C1QAP02745 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C1QAP02745 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1QAP02745 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1QAP02745 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QAP02745 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QAP02745 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QAP02745 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QAP02745 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QAP02745 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QAP02745 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QAP02745 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QAP02745 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QAP02745 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QAP02745 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QAP02745 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QAP02745 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QAP02745 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QAP02745 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QAP02745 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QAP02745 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QAP02745 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QAP02745 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QAP02745 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QAP02745 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QAP02745 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QAP02745 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1QAP02745 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1QAP02745 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1QAP02745 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C1QAP02745 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1QAP02745 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1QAP02745 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1QAP02745 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QAP02745 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QAP02745 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QAP02745 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QAP02745 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QAP02745 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QAP02745 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QAP02745 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QAP02745 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QAP02745 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QAP02745 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QAP02745 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QAP02745 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QAP02745 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QAP02745 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QAP02745 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QAP02745 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QAP02745 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C1QAP02745 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QAP02745 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QAP02745 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QAP02745 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QAP02745 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QAP02745 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QAP02745 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QAP02745 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QAP02745 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QAP02745 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QAP02745 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QAP02745 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QAP02745 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QAP02745 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QAP02745 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QAP02745 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QAP02745 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QAP02745 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QAP02745 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QAP02745 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QAP02745 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QAP02745 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QAP02745 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QAP02745 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QAP02745 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QAP02745 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QAP02745 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QAP02745 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QAP02745 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QAP02745 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QAP02745 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QAP02745 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QAP02745 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QAP02745 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QAP02745 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QAP02745 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QAP02745 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QAP02745 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QAP02745 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QAP02745 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QAP02745 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QAP02745 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QAP02745 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QAP02745 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QAP02745 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1QAP02745 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms