Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFDP00746 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFDP00746 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFDP00746 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFDP00746 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFDP00746 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFDP00746 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFDP00746 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFDP00746 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFDP00746 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFDP00746 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFDP00746 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFDP00746 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFDP00746 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFDP00746 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFDP00746 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CFDP00746 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFDP00746 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFDP00746 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFDP00746 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFDP00746 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFDP00746 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFDP00746 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFDP00746 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFDP00746 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFDP00746 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFDP00746 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CFDP00746 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFDP00746 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFDP00746 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFDP00746 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFDP00746 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFDP00746 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFDP00746 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFDP00746 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFDP00746 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFDP00746 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFDP00746 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFDP00746 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFDP00746 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFDP00746 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFDP00746 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFDP00746 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFDP00746 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CFDP00746 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFDP00746 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFDP00746 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFDP00746 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFDP00746 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFDP00746 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFDP00746 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFDP00746 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFDP00746 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFDP00746 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFDP00746 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFDP00746 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFDP00746 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFDP00746 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFDP00746 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFDP00746 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFDP00746 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFDP00746 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFDP00746 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFDP00746 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFDP00746 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFDP00746 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFDP00746 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFDP00746 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFDP00746 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFDP00746 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFDP00746 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFDP00746 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFDP00746 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFDP00746 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFDP00746 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFDP00746 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFDP00746 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFDP00746 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFDP00746 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFDP00746 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFDP00746 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFDP00746 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFDP00746 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFDP00746 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFDP00746 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFDP00746 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFDP00746 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFDP00746 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFDP00746 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFDP00746 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFDP00746 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFDP00746 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFDP00746 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFDP00746 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFDP00746 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFDP00746 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFDP00746 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFDP00746 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFDP00746 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFDP00746 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms