Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PALMO75781 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PALMO75781 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALMO75781 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALMO75781 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALMO75781 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALMO75781 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALMO75781 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PALMO75781 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALMO75781 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALMO75781 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALMO75781 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALMO75781 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALMO75781 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALMO75781 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALMO75781 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PALMO75781 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALMO75781 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALMO75781 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALMO75781 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALMO75781 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALMO75781 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALMO75781 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PALMO75781 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PALMO75781 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALMO75781 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALMO75781 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALMO75781 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALMO75781 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALMO75781 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALMO75781 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALMO75781 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALMO75781 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALMO75781 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMO75781 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALMO75781 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALMO75781 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALMO75781 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALMO75781 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALMO75781 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALMO75781 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALMO75781 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALMO75781 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALMO75781 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALMO75781 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALMO75781 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALMO75781 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALMO75781 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALMO75781 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALMO75781 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALMO75781 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALMO75781 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALMO75781 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALMO75781 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALMO75781 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALMO75781 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALMO75781 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALMO75781 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALMO75781 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALMO75781 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALMO75781 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALMO75781 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALMO75781 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALMO75781 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALMO75781 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMO75781 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALMO75781 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALMO75781 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALMO75781 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALMO75781 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALMO75781 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALMO75781 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALMO75781 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALMO75781 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALMO75781 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALMO75781 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALMO75781 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALMO75781 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALMO75781 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALMO75781 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALMO75781 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALMO75781 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PALMO75781 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms