Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEMFO60524 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEMFO60524 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEMFO60524 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEMFO60524 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NEMFO60524 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEMFO60524 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEMFO60524 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEMFO60524 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEMFO60524 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEMFO60524 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEMFO60524 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEMFO60524 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEMFO60524 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEMFO60524 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEMFO60524 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NEMFO60524 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEMFO60524 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEMFO60524 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEMFO60524 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEMFO60524 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEMFO60524 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEMFO60524 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEMFO60524 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEMFO60524 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEMFO60524 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEMFO60524 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEMFO60524 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEMFO60524 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEMFO60524 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEMFO60524 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEMFO60524 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEMFO60524 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEMFO60524 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEMFO60524 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEMFO60524 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEMFO60524 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEMFO60524 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEMFO60524 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEMFO60524 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEMFO60524 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEMFO60524 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NEMFO60524 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEMFO60524 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEMFO60524 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEMFO60524 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEMFO60524 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEMFO60524 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEMFO60524 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEMFO60524 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEMFO60524 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEMFO60524 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEMFO60524 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEMFO60524 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEMFO60524 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEMFO60524 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEMFO60524 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEMFO60524 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEMFO60524 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEMFO60524 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEMFO60524 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEMFO60524 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEMFO60524 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEMFO60524 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEMFO60524 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEMFO60524 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEMFO60524 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEMFO60524 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEMFO60524 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NEMFO60524 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NEMFO60524 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEMFO60524 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEMFO60524 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEMFO60524 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEMFO60524 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEMFO60524 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEMFO60524 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEMFO60524 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEMFO60524 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEMFO60524 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEMFO60524 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEMFO60524 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEMFO60524 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEMFO60524 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEMFO60524 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEMFO60524 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEMFO60524 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEMFO60524 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEMFO60524 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEMFO60524 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEMFO60524 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEMFO60524 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEMFO60524 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEMFO60524 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEMFO60524 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEMFO60524 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEMFO60524 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEMFO60524 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEMFO60524 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEMFO60524 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms