Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRD6O60522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD6O60522 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRD6O60522 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD6O60522 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD6O60522 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms