Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PLXNC1O60486 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PLXNC1O60486 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
PLXNC1O60486 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PLXNC1O60486 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PLXNC1O60486 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PLXNC1O60486 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PLXNC1O60486 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PLXNC1O60486 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PLXNC1O60486 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
PLXNC1O60486 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PLXNC1O60486 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PLXNC1O60486 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PLXNC1O60486 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
PLXNC1O60486 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PLXNC1O60486 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PLXNC1O60486 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms