Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IDH3BO43837 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3BO43837 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3BO43837 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3BO43837 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3BO43837 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3BO43837 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms