Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BUD23O43709 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BUD23O43709 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BUD23O43709 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BUD23O43709 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BUD23O43709 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BUD23O43709 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BUD23O43709 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BUD23O43709 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BUD23O43709 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BUD23O43709 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BUD23O43709 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BUD23O43709 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BUD23O43709 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BUD23O43709 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BUD23O43709 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BUD23O43709 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BUD23O43709 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BUD23O43709 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BUD23O43709 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BUD23O43709 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BUD23O43709 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BUD23O43709 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BUD23O43709 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BUD23O43709 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BUD23O43709 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BUD23O43709 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BUD23O43709 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BUD23O43709 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BUD23O43709 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BUD23O43709 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BUD23O43709 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BUD23O43709 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BUD23O43709 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BUD23O43709 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BUD23O43709 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BUD23O43709 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BUD23O43709 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BUD23O43709 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BUD23O43709 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BUD23O43709 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BUD23O43709 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BUD23O43709 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BUD23O43709 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BUD23O43709 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BUD23O43709 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BUD23O43709 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BUD23O43709 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BUD23O43709 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BUD23O43709 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BUD23O43709 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BUD23O43709 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BUD23O43709 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BUD23O43709 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BUD23O43709 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BUD23O43709 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BUD23O43709 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BUD23O43709 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BUD23O43709 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BUD23O43709 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BUD23O43709 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BUD23O43709 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BUD23O43709 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BUD23O43709 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BUD23O43709 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BUD23O43709 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BUD23O43709 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BUD23O43709 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BUD23O43709 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BUD23O43709 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BUD23O43709 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BUD23O43709 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BUD23O43709 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BUD23O43709 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BUD23O43709 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BUD23O43709 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BUD23O43709 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BUD23O43709 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BUD23O43709 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BUD23O43709 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BUD23O43709 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BUD23O43709 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BUD23O43709 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BUD23O43709 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BUD23O43709 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BUD23O43709 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BUD23O43709 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BUD23O43709 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BUD23O43709 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BUD23O43709 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BUD23O43709 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BUD23O43709 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BUD23O43709 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BUD23O43709 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BUD23O43709 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BUD23O43709 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BUD23O43709 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BUD23O43709 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BUD23O43709 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BUD23O43709 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms