Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASA4O43374 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASA4O43374 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASA4O43374 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASA4O43374 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RASA4O43374 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASA4O43374 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASA4O43374 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASA4O43374 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASA4O43374 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASA4O43374 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASA4O43374 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASA4O43374 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASA4O43374 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASA4O43374 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASA4O43374 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RASA4O43374 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RASA4O43374 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASA4O43374 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RASA4O43374 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASA4O43374 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASA4O43374 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASA4O43374 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASA4O43374 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASA4O43374 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASA4O43374 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA4O43374 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA4O43374 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA4O43374 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA4O43374 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASA4O43374 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA4O43374 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA4O43374 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA4O43374 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASA4O43374 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA4O43374 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA4O43374 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA4O43374 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA4O43374 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASA4O43374 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA4O43374 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASA4O43374 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA4O43374 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA4O43374 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA4O43374 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASA4O43374 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA4O43374 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASA4O43374 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA4O43374 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA4O43374 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA4O43374 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASA4O43374 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA4O43374 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA4O43374 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA4O43374 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASA4O43374 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA4O43374 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA4O43374 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA4O43374 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA4O43374 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA4O43374 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASA4O43374 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA4O43374 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA4O43374 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASA4O43374 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA4O43374 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA4O43374 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASA4O43374 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA4O43374 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA4O43374 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA4O43374 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA4O43374 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASA4O43374 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RASA4O43374 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA4O43374 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA4O43374 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA4O43374 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA4O43374 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA4O43374 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASA4O43374 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASA4O43374 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASA4O43374 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RASA4O43374 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RASA4O43374 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RASA4O43374 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RASA4O43374 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RASA4O43374 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RASA4O43374 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASA4O43374 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASA4O43374 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASA4O43374 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RASA4O43374 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RASA4O43374 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RASA4O43374 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASA4O43374 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASA4O43374 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASA4O43374 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASA4O43374 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASA4O43374 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASA4O43374 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms