Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SURF4O15260 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SURF4O15260 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SURF4O15260 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SURF4O15260 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SURF4O15260 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF4O15260 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF4O15260 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF4O15260 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF4O15260 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF4O15260 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF4O15260 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF4O15260 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF4O15260 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF4O15260 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF4O15260 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF4O15260 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF4O15260 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF4O15260 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF4O15260 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF4O15260 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF4O15260 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF4O15260 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF4O15260 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF4O15260 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF4O15260 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF4O15260 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF4O15260 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF4O15260 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF4O15260 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF4O15260 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF4O15260 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF4O15260 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF4O15260 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF4O15260 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF4O15260 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF4O15260 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF4O15260 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF4O15260 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF4O15260 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF4O15260 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF4O15260 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF4O15260 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF4O15260 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF4O15260 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF4O15260 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF4O15260 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF4O15260 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF4O15260 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF4O15260 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF4O15260 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF4O15260 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF4O15260 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF4O15260 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF4O15260 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF4O15260 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF4O15260 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF4O15260 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF4O15260 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF4O15260 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF4O15260 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF4O15260 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF4O15260 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF4O15260 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF4O15260 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF4O15260 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF4O15260 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF4O15260 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF4O15260 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF4O15260 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF4O15260 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF4O15260 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF4O15260 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF4O15260 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF4O15260 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF4O15260 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF4O15260 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF4O15260 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF4O15260 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF4O15260 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF4O15260 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF4O15260 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF4O15260 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF4O15260 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF4O15260 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF4O15260 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF4O15260 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF4O15260 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF4O15260 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms