Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN8O00124 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN8O00124 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN8O00124 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN8O00124 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN8O00124 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN8O00124 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN8O00124 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN8O00124 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN8O00124 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms