Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NACAE9PAV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NACAE9PAV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NACAE9PAV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NACAE9PAV3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 381.1 ms