Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49D1C9J1S8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49D1C9J1S8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM49D1C9J1S8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM49D1C9J1S8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms