Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG5

FAM25C, Protein FAM25C, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25CB3EWG5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM25CB3EWG5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM25CB3EWG5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM25CB3EWG5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25CB3EWG5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25CB3EWG5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25CB3EWG5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25CB3EWG5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25CB3EWG5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM25CB3EWG5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM25CB3EWG5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25CB3EWG5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM25CB3EWG5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM25CB3EWG5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM25CB3EWG5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms